Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms