Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms