Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V8

BSX, Brain-specific homeobox protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSXQ3C1V8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BSXQ3C1V8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms