Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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RTL8BQ17RB0 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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RTL8BQ17RB0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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RTL8BQ17RB0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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RTL8BQ17RB0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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RTL8BQ17RB0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTL8BQ17RB0 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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