Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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CTF1Q16619 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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CTF1Q16619 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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