Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP7Q16576 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms