Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms