Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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