Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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VAMP3Q15836 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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VAMP3Q15836 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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VAMP3Q15836 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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VAMP3Q15836 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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VAMP3Q15836 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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VAMP3Q15836 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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VAMP3Q15836 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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VAMP3Q15836 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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VAMP3Q15836 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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VAMP3Q15836 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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VAMP3Q15836 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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