Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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