Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FRMPD4Q14CM0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FRMPD4Q14CM0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FRMPD4Q14CM0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
FRMPD4Q14CM0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
FRMPD4Q14CM0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FRMPD4Q14CM0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD4Q14CM0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD4Q14CM0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD4Q14CM0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD4Q14CM0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD4Q14CM0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD4Q14CM0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD4Q14CM0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD4Q14CM0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD4Q14CM0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD4Q14CM0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD4Q14CM0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD4Q14CM0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD4Q14CM0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD4Q14CM0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD4Q14CM0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD4Q14CM0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD4Q14CM0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD4Q14CM0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD4Q14CM0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMPD4Q14CM0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMPD4Q14CM0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMPD4Q14CM0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMPD4Q14CM0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMPD4Q14CM0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMPD4Q14CM0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMPD4Q14CM0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMPD4Q14CM0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMPD4Q14CM0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMPD4Q14CM0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMPD4Q14CM0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMPD4Q14CM0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMPD4Q14CM0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMPD4Q14CM0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMPD4Q14CM0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMPD4Q14CM0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMPD4Q14CM0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMPD4Q14CM0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMPD4Q14CM0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMPD4Q14CM0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMPD4Q14CM0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms