Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
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