Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNGB1Q14028 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNGB1Q14028 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNGB1Q14028 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNGB1Q14028 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNGB1Q14028 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNGB1Q14028 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNGB1Q14028 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNGB1Q14028 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNGB1Q14028 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms