Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
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