Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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CDH18Q13634 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
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