Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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