Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LSAMPQ13449 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 319.2 ms