Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.374e-7■■■□□ 16.8
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ILF3Q12906 DNAJC5-202ENST00000470551 5287 ntTSL 213.83□□□□□ -0.28e-7■■■□□ 16.8
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ILF3Q12906 HSPA9-203ENST00000504810 584 ntTSL 36.08□□□□□ -1.443e-6■■■□□ 16.8
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ILF3Q12906 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.234e-7■■■□□ 16.8
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ILF3Q12906 MARK3-220ENST00000560417 579 ntTSL 35.3□□□□□ -1.568e-9■■■□□ 16.8
ILF3Q12906 NOP58-203ENST00000433543 714 ntTSL 34.58□□□□□ -1.684e-6■■■□□ 16.8
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ILF3Q12906 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.083e-6■■■□□ 16.8
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ILF3Q12906 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.371e-6■■■□□ 16.7
ILF3Q12906 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.411e-6■■■□□ 16.7
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ILF3Q12906 KIF13A-203ENST00000378814 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.956e-7■■■□□ 16.7
ILF3Q12906 KIF13A-204ENST00000378826 5747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.986e-7■■■□□ 16.7
ILF3Q12906 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.236e-7■■■□□ 16.7
ILF3Q12906 KIF13A-209ENST00000505588 212 ntTSL 52.91□□□□□ -1.946e-7■■■□□ 16.7
ILF3Q12906 FBXO11-202ENST00000403359 4055 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.151e-28■■■□□ 16.7
ILF3Q12906 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.155e-14■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 SERPINA3-208ENST00000556968 1289 ntTSL 1 (best)11.03□□□□□ -0.645e-14■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 SERPINA3-201ENST00000393078 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.685e-14■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 SERPINA3-202ENST00000393080 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.685e-14■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 SERPINA3-206ENST00000555820 981 ntTSL 510.26□□□□□ -0.775e-14■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 SERPINA3-207ENST00000556388 480 ntTSL 48.67□□□□□ -1.025e-14■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 SERPINA3-205ENST00000485588 575 ntTSL 1 (best)8.66□□□□□ -1.025e-14■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 AL049839.2-201ENST00000553947 3067 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.085e-14■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.744e-7■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.674e-7■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.184e-7■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 RBM26-201ENST00000267229 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.864e-7■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.843e-8■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.573e-8■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.513e-8■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.223e-8■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 PEG3-209ENST00000599577 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)14.97□□□□□ -0.013e-8■■■□□ 16.6
ILF3Q12906 PEG3-202ENST00000593695 4741 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.463e-8■■■□□ 16.6
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