Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BPTFQ12830 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms