Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
AP1B1Q10567 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms