Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms