Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms