Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms