Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPN11Q06124 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPN11Q06124 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPN11Q06124 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN11Q06124 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN11Q06124 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN11Q06124 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN11Q06124 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN11Q06124 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN11Q06124 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN11Q06124 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN11Q06124 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN11Q06124 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN11Q06124 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN11Q06124 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN11Q06124 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN11Q06124 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN11Q06124 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN11Q06124 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN11Q06124 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPN11Q06124 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN11Q06124 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN11Q06124 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN11Q06124 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN11Q06124 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN11Q06124 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN11Q06124 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN11Q06124 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN11Q06124 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN11Q06124 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN11Q06124 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN11Q06124 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN11Q06124 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN11Q06124 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN11Q06124 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPN11Q06124 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN11Q06124 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPN11Q06124 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPN11Q06124 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN11Q06124 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPN11Q06124 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN11Q06124 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN11Q06124 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN11Q06124 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN11Q06124 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN11Q06124 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN11Q06124 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN11Q06124 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN11Q06124 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN11Q06124 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPN11Q06124 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms