Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms