Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX2Q04743 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms