Protein–RNA interactions for Protein: Q00604

NDP, Norrin, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDPQ00604 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDPQ00604 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDPQ00604 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDPQ00604 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDPQ00604 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDPQ00604 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDPQ00604 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDPQ00604 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NDPQ00604 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDPQ00604 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDPQ00604 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDPQ00604 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDPQ00604 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDPQ00604 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NDPQ00604 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDPQ00604 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDPQ00604 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDPQ00604 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDPQ00604 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDPQ00604 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDPQ00604 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDPQ00604 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDPQ00604 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDPQ00604 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDPQ00604 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDPQ00604 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDPQ00604 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDPQ00604 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDPQ00604 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDPQ00604 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDPQ00604 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDPQ00604 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDPQ00604 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDPQ00604 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NDPQ00604 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDPQ00604 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDPQ00604 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDPQ00604 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDPQ00604 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDPQ00604 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDPQ00604 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDPQ00604 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDPQ00604 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDPQ00604 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDPQ00604 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDPQ00604 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDPQ00604 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDPQ00604 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDPQ00604 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDPQ00604 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDPQ00604 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDPQ00604 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDPQ00604 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDPQ00604 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDPQ00604 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDPQ00604 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDPQ00604 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDPQ00604 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDPQ00604 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDPQ00604 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDPQ00604 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDPQ00604 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDPQ00604 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDPQ00604 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NDPQ00604 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDPQ00604 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDPQ00604 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDPQ00604 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDPQ00604 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDPQ00604 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDPQ00604 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDPQ00604 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDPQ00604 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDPQ00604 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDPQ00604 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDPQ00604 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDPQ00604 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDPQ00604 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDPQ00604 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDPQ00604 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDPQ00604 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDPQ00604 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDPQ00604 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDPQ00604 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDPQ00604 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDPQ00604 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDPQ00604 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDPQ00604 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDPQ00604 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDPQ00604 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDPQ00604 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDPQ00604 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDPQ00604 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDPQ00604 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NDPQ00604 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDPQ00604 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NDPQ00604 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDPQ00604 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDPQ00604 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDPQ00604 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms