Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHOBP62745 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHOBP62745 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHOBP62745 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHOBP62745 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RHOBP62745 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RHOBP62745 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RHOBP62745 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RHOBP62745 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RHOBP62745 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RHOBP62745 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RHOBP62745 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOBP62745 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOBP62745 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOBP62745 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOBP62745 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOBP62745 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOBP62745 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOBP62745 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOBP62745 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOBP62745 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOBP62745 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOBP62745 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOBP62745 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOBP62745 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOBP62745 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOBP62745 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOBP62745 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOBP62745 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOBP62745 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOBP62745 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOBP62745 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOBP62745 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOBP62745 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOBP62745 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOBP62745 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOBP62745 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOBP62745 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOBP62745 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOBP62745 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOBP62745 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOBP62745 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOBP62745 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOBP62745 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOBP62745 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOBP62745 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOBP62745 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOBP62745 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOBP62745 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOBP62745 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOBP62745 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOBP62745 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOBP62745 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOBP62745 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOBP62745 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOBP62745 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOBP62745 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOBP62745 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOBP62745 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOBP62745 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOBP62745 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOBP62745 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOBP62745 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOBP62745 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOBP62745 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOBP62745 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOBP62745 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOBP62745 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOBP62745 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOBP62745 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOBP62745 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOBP62745 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOBP62745 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOBP62745 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOBP62745 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOBP62745 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOBP62745 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOBP62745 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOBP62745 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOBP62745 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOBP62745 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOBP62745 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOBP62745 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOBP62745 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOBP62745 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOBP62745 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOBP62745 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOBP62745 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOBP62745 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOBP62745 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOBP62745 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOBP62745 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOBP62745 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOBP62745 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOBP62745 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOBP62745 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOBP62745 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOBP62745 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOBP62745 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOBP62745 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms