Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms