Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA9P57773 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA9P57773 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA9P57773 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA9P57773 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA9P57773 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA9P57773 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA9P57773 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJA9P57773 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJA9P57773 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJA9P57773 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJA9P57773 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJA9P57773 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJA9P57773 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJA9P57773 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJA9P57773 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA9P57773 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA9P57773 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA9P57773 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA9P57773 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA9P57773 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA9P57773 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA9P57773 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA9P57773 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA9P57773 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA9P57773 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA9P57773 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA9P57773 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA9P57773 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA9P57773 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA9P57773 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA9P57773 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA9P57773 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA9P57773 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA9P57773 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA9P57773 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA9P57773 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA9P57773 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA9P57773 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA9P57773 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA9P57773 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA9P57773 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA9P57773 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA9P57773 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA9P57773 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA9P57773 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA9P57773 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA9P57773 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA9P57773 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA9P57773 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA9P57773 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA9P57773 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA9P57773 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA9P57773 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA9P57773 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA9P57773 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA9P57773 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA9P57773 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA9P57773 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA9P57773 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA9P57773 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA9P57773 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA9P57773 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA9P57773 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA9P57773 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA9P57773 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA9P57773 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA9P57773 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA9P57773 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA9P57773 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA9P57773 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA9P57773 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA9P57773 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA9P57773 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA9P57773 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA9P57773 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA9P57773 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA9P57773 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA9P57773 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA9P57773 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA9P57773 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA9P57773 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA9P57773 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA9P57773 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA9P57773 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA9P57773 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA9P57773 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA9P57773 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA9P57773 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA9P57773 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA9P57773 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA9P57773 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA9P57773 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA9P57773 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA9P57773 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA9P57773 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA9P57773 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA9P57773 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA9P57773 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA9P57773 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms