Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms