Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms