Protein–RNA interactions for Protein: P48380

RFX3, Transcription factor RFX3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3P48380 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RFX3P48380 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFX3P48380 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFX3P48380 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFX3P48380 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFX3P48380 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFX3P48380 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFX3P48380 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFX3P48380 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFX3P48380 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFX3P48380 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFX3P48380 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RFX3P48380 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RFX3P48380 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RFX3P48380 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RFX3P48380 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RFX3P48380 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RFX3P48380 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RFX3P48380 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFX3P48380 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFX3P48380 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFX3P48380 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFX3P48380 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFX3P48380 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFX3P48380 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFX3P48380 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFX3P48380 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFX3P48380 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFX3P48380 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFX3P48380 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFX3P48380 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFX3P48380 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFX3P48380 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFX3P48380 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFX3P48380 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFX3P48380 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFX3P48380 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFX3P48380 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFX3P48380 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFX3P48380 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFX3P48380 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFX3P48380 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFX3P48380 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFX3P48380 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFX3P48380 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFX3P48380 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFX3P48380 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFX3P48380 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RFX3P48380 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFX3P48380 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFX3P48380 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFX3P48380 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFX3P48380 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFX3P48380 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RFX3P48380 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RFX3P48380 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFX3P48380 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFX3P48380 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFX3P48380 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFX3P48380 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RFX3P48380 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFX3P48380 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFX3P48380 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFX3P48380 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFX3P48380 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFX3P48380 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFX3P48380 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFX3P48380 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFX3P48380 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFX3P48380 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFX3P48380 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFX3P48380 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFX3P48380 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFX3P48380 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFX3P48380 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFX3P48380 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFX3P48380 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFX3P48380 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFX3P48380 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFX3P48380 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFX3P48380 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFX3P48380 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFX3P48380 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFX3P48380 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFX3P48380 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFX3P48380 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFX3P48380 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFX3P48380 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFX3P48380 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFX3P48380 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFX3P48380 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFX3P48380 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RFX3P48380 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RFX3P48380 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFX3P48380 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFX3P48380 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFX3P48380 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFX3P48380 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFX3P48380 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFX3P48380 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms