Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP8P40818 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP8P40818 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP8P40818 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
USP8P40818 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP8P40818 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP8P40818 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP8P40818 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP8P40818 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP8P40818 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP8P40818 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP8P40818 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP8P40818 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
USP8P40818 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP8P40818 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP8P40818 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP8P40818 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP8P40818 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP8P40818 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP8P40818 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP8P40818 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
USP8P40818 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP8P40818 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP8P40818 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP8P40818 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP8P40818 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP8P40818 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
USP8P40818 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP8P40818 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP8P40818 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP8P40818 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP8P40818 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
USP8P40818 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP8P40818 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP8P40818 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP8P40818 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP8P40818 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP8P40818 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP8P40818 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP8P40818 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP8P40818 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP8P40818 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP8P40818 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP8P40818 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP8P40818 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP8P40818 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
USP8P40818 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP8P40818 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP8P40818 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP8P40818 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP8P40818 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP8P40818 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP8P40818 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP8P40818 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP8P40818 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP8P40818 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP8P40818 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP8P40818 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP8P40818 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP8P40818 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP8P40818 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP8P40818 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP8P40818 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP8P40818 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP8P40818 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP8P40818 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP8P40818 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
USP8P40818 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP8P40818 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP8P40818 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP8P40818 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP8P40818 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP8P40818 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP8P40818 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP8P40818 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP8P40818 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP8P40818 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP8P40818 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP8P40818 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP8P40818 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
USP8P40818 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP8P40818 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP8P40818 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
USP8P40818 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
USP8P40818 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
USP8P40818 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
USP8P40818 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
USP8P40818 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
USP8P40818 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
USP8P40818 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
USP8P40818 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
USP8P40818 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
USP8P40818 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
USP8P40818 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
USP8P40818 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
USP8P40818 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
USP8P40818 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
USP8P40818 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
USP8P40818 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
USP8P40818 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms