Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP5C1P36542 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms