Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms