Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP6P35125 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP6P35125 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP6P35125 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP6P35125 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP6P35125 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP6P35125 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP6P35125 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP6P35125 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP6P35125 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP6P35125 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP6P35125 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
USP6P35125 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP6P35125 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP6P35125 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP6P35125 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP6P35125 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP6P35125 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP6P35125 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP6P35125 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP6P35125 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP6P35125 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP6P35125 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP6P35125 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP6P35125 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP6P35125 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP6P35125 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
USP6P35125 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
USP6P35125 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
USP6P35125 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
USP6P35125 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
USP6P35125 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP6P35125 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP6P35125 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP6P35125 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP6P35125 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP6P35125 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP6P35125 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP6P35125 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
USP6P35125 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP6P35125 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP6P35125 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP6P35125 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP6P35125 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP6P35125 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP6P35125 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP6P35125 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP6P35125 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP6P35125 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP6P35125 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP6P35125 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP6P35125 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
USP6P35125 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP6P35125 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP6P35125 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP6P35125 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP6P35125 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP6P35125 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP6P35125 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP6P35125 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP6P35125 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP6P35125 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP6P35125 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP6P35125 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP6P35125 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP6P35125 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP6P35125 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP6P35125 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP6P35125 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP6P35125 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP6P35125 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP6P35125 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP6P35125 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP6P35125 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP6P35125 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
USP6P35125 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP6P35125 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP6P35125 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP6P35125 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP6P35125 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP6P35125 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
USP6P35125 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP6P35125 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP6P35125 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP6P35125 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
USP6P35125 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
USP6P35125 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP6P35125 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP6P35125 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP6P35125 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP6P35125 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP6P35125 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP6P35125 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP6P35125 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP6P35125 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP6P35125 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP6P35125 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP6P35125 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP6P35125 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP6P35125 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms