Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP5DP30049 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
ATP5DP30049 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
ATP5DP30049 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ATP5DP30049 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ATP5DP30049 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ATP5DP30049 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
ATP5DP30049 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP5DP30049 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP5DP30049 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP5DP30049 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP5DP30049 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP5DP30049 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP5DP30049 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP5DP30049 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP5DP30049 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP5DP30049 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP5DP30049 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP5DP30049 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP5DP30049 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP5DP30049 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP5DP30049 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP5DP30049 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms