Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXP28300 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXP28300 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXP28300 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXP28300 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXP28300 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXP28300 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXP28300 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXP28300 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXP28300 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXP28300 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXP28300 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXP28300 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXP28300 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXP28300 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXP28300 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXP28300 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXP28300 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXP28300 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXP28300 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXP28300 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXP28300 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXP28300 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXP28300 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXP28300 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXP28300 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXP28300 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXP28300 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXP28300 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXP28300 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXP28300 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXP28300 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXP28300 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXP28300 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXP28300 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXP28300 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXP28300 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXP28300 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXP28300 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXP28300 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXP28300 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXP28300 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXP28300 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXP28300 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXP28300 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXP28300 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXP28300 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXP28300 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXP28300 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXP28300 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXP28300 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXP28300 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXP28300 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXP28300 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXP28300 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXP28300 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXP28300 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXP28300 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXP28300 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXP28300 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXP28300 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXP28300 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXP28300 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXP28300 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXP28300 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXP28300 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXP28300 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXP28300 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXP28300 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXP28300 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXP28300 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXP28300 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXP28300 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXP28300 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXP28300 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXP28300 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXP28300 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXP28300 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXP28300 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXP28300 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXP28300 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXP28300 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXP28300 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXP28300 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXP28300 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXP28300 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXP28300 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXP28300 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXP28300 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXP28300 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXP28300 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXP28300 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXP28300 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXP28300 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXP28300 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXP28300 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXP28300 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXP28300 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXP28300 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXP28300 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms