Protein–RNA interactions for Protein: P23511

NFYA, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFYAP23511 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFYAP23511 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFYAP23511 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFYAP23511 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NFYAP23511 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFYAP23511 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFYAP23511 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFYAP23511 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFYAP23511 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFYAP23511 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFYAP23511 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFYAP23511 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFYAP23511 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFYAP23511 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFYAP23511 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFYAP23511 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFYAP23511 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFYAP23511 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFYAP23511 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFYAP23511 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFYAP23511 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFYAP23511 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NFYAP23511 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFYAP23511 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFYAP23511 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFYAP23511 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFYAP23511 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFYAP23511 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFYAP23511 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NFYAP23511 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFYAP23511 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFYAP23511 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFYAP23511 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFYAP23511 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFYAP23511 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFYAP23511 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NFYAP23511 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFYAP23511 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFYAP23511 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFYAP23511 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFYAP23511 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFYAP23511 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFYAP23511 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFYAP23511 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFYAP23511 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFYAP23511 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFYAP23511 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NFYAP23511 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFYAP23511 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NFYAP23511 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NFYAP23511 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NFYAP23511 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFYAP23511 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFYAP23511 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFYAP23511 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFYAP23511 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NFYAP23511 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFYAP23511 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFYAP23511 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFYAP23511 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFYAP23511 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFYAP23511 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFYAP23511 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFYAP23511 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFYAP23511 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFYAP23511 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFYAP23511 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFYAP23511 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFYAP23511 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFYAP23511 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFYAP23511 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFYAP23511 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFYAP23511 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFYAP23511 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFYAP23511 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFYAP23511 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFYAP23511 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFYAP23511 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFYAP23511 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFYAP23511 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFYAP23511 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFYAP23511 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NFYAP23511 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFYAP23511 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFYAP23511 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFYAP23511 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFYAP23511 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFYAP23511 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFYAP23511 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFYAP23511 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFYAP23511 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFYAP23511 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFYAP23511 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFYAP23511 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFYAP23511 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFYAP23511 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFYAP23511 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFYAP23511 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NFYAP23511 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NFYAP23511 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms