Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPREP23469 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPREP23469 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPREP23469 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPREP23469 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPREP23469 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPREP23469 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPREP23469 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPREP23469 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPREP23469 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPREP23469 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPREP23469 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPREP23469 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPREP23469 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPREP23469 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPREP23469 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPREP23469 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPREP23469 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPREP23469 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPREP23469 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPREP23469 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPREP23469 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPREP23469 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPREP23469 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPREP23469 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPREP23469 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPREP23469 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPREP23469 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPREP23469 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPREP23469 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPREP23469 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPREP23469 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPREP23469 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPREP23469 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPREP23469 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPREP23469 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPREP23469 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPREP23469 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPREP23469 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPREP23469 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPREP23469 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPREP23469 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPREP23469 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPREP23469 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPREP23469 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPREP23469 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPREP23469 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPREP23469 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPREP23469 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPREP23469 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPREP23469 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPREP23469 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPREP23469 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPREP23469 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPREP23469 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPREP23469 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPREP23469 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPREP23469 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPREP23469 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPREP23469 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPREP23469 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPREP23469 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPREP23469 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPREP23469 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPREP23469 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPREP23469 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPREP23469 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPREP23469 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPREP23469 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPREP23469 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPREP23469 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPREP23469 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPREP23469 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPREP23469 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPREP23469 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPREP23469 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPREP23469 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPREP23469 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPREP23469 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPREP23469 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPREP23469 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPREP23469 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPREP23469 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPREP23469 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPREP23469 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPREP23469 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPREP23469 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPREP23469 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPREP23469 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPREP23469 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPREP23469 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPREP23469 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPREP23469 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPREP23469 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPREP23469 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPREP23469 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPREP23469 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPREP23469 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPREP23469 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPREP23469 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms