Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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