Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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RAB4AP20338 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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RAB4AP20338 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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RAB4AP20338 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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RAB4AP20338 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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RAB4AP20338 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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RAB4AP20338 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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