Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDSP20132 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDSP20132 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDSP20132 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SDSP20132 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SDSP20132 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDSP20132 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDSP20132 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDSP20132 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDSP20132 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDSP20132 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDSP20132 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDSP20132 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDSP20132 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDSP20132 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDSP20132 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDSP20132 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDSP20132 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDSP20132 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDSP20132 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDSP20132 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDSP20132 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDSP20132 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDSP20132 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDSP20132 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDSP20132 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SDSP20132 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SDSP20132 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SDSP20132 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDSP20132 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDSP20132 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDSP20132 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDSP20132 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDSP20132 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDSP20132 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDSP20132 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDSP20132 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDSP20132 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDSP20132 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDSP20132 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDSP20132 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDSP20132 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDSP20132 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDSP20132 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDSP20132 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDSP20132 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDSP20132 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDSP20132 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDSP20132 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDSP20132 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDSP20132 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDSP20132 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDSP20132 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDSP20132 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SDSP20132 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDSP20132 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDSP20132 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SDSP20132 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDSP20132 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDSP20132 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDSP20132 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDSP20132 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDSP20132 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDSP20132 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDSP20132 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDSP20132 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDSP20132 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDSP20132 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SDSP20132 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDSP20132 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SDSP20132 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDSP20132 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDSP20132 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDSP20132 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SDSP20132 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SDSP20132 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
SDSP20132 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SDSP20132 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDSP20132 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDSP20132 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDSP20132 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDSP20132 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDSP20132 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDSP20132 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDSP20132 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SDSP20132 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SDSP20132 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDSP20132 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDSP20132 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDSP20132 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDSP20132 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDSP20132 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDSP20132 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDSP20132 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDSP20132 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDSP20132 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDSP20132 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDSP20132 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDSP20132 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDSP20132 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms