Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAV1P15498 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAV1P15498 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAV1P15498 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAV1P15498 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAV1P15498 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAV1P15498 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAV1P15498 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAV1P15498 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAV1P15498 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAV1P15498 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAV1P15498 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAV1P15498 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAV1P15498 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAV1P15498 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAV1P15498 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAV1P15498 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
VAV1P15498 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAV1P15498 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAV1P15498 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAV1P15498 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAV1P15498 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
VAV1P15498 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAV1P15498 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAV1P15498 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAV1P15498 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAV1P15498 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAV1P15498 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAV1P15498 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAV1P15498 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAV1P15498 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAV1P15498 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAV1P15498 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAV1P15498 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAV1P15498 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAV1P15498 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAV1P15498 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAV1P15498 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAV1P15498 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAV1P15498 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAV1P15498 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAV1P15498 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAV1P15498 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAV1P15498 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAV1P15498 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAV1P15498 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAV1P15498 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAV1P15498 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAV1P15498 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAV1P15498 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAV1P15498 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAV1P15498 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAV1P15498 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAV1P15498 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAV1P15498 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAV1P15498 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAV1P15498 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAV1P15498 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAV1P15498 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
VAV1P15498 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAV1P15498 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
VAV1P15498 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAV1P15498 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAV1P15498 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAV1P15498 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAV1P15498 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAV1P15498 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAV1P15498 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAV1P15498 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAV1P15498 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAV1P15498 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAV1P15498 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAV1P15498 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAV1P15498 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAV1P15498 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAV1P15498 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAV1P15498 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAV1P15498 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAV1P15498 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAV1P15498 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAV1P15498 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAV1P15498 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAV1P15498 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAV1P15498 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAV1P15498 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAV1P15498 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAV1P15498 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAV1P15498 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
VAV1P15498 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAV1P15498 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAV1P15498 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAV1P15498 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAV1P15498 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAV1P15498 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAV1P15498 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAV1P15498 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAV1P15498 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAV1P15498 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAV1P15498 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAV1P15498 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms