Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNNT1P13805 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms