Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GLI4P10075 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GLI4P10075 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GLI4P10075 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GLI4P10075 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GLI4P10075 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GLI4P10075 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GLI4P10075 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GLI4P10075 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GLI4P10075 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GLI4P10075 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GLI4P10075 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GLI4P10075 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GLI4P10075 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GLI4P10075 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GLI4P10075 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GLI4P10075 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GLI4P10075 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GLI4P10075 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GLI4P10075 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GLI4P10075 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GLI4P10075 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GLI4P10075 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GLI4P10075 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GLI4P10075 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GLI4P10075 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GLI4P10075 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GLI4P10075 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GLI4P10075 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GLI4P10075 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GLI4P10075 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GLI4P10075 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GLI4P10075 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GLI4P10075 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GLI4P10075 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GLI4P10075 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GLI4P10075 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GLI4P10075 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GLI4P10075 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GLI4P10075 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GLI4P10075 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GLI4P10075 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GLI4P10075 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GLI4P10075 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GLI4P10075 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GLI4P10075 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GLI4P10075 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GLI4P10075 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GLI4P10075 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GLI4P10075 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GLI4P10075 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GLI4P10075 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GLI4P10075 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GLI4P10075 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GLI4P10075 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GLI4P10075 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GLI4P10075 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GLI4P10075 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GLI4P10075 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GLI4P10075 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GLI4P10075 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GLI4P10075 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GLI4P10075 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GLI4P10075 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GLI4P10075 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GLI4P10075 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GLI4P10075 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GLI4P10075 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GLI4P10075 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GLI4P10075 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GLI4P10075 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GLI4P10075 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GLI4P10075 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GLI4P10075 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GLI4P10075 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GLI4P10075 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GLI4P10075 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GLI4P10075 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GLI4P10075 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GLI4P10075 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GLI4P10075 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GLI4P10075 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GLI4P10075 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GLI4P10075 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GLI4P10075 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GLI4P10075 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GLI4P10075 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GLI4P10075 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GLI4P10075 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GLI4P10075 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GLI4P10075 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GLI4P10075 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GLI4P10075 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GLI4P10075 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GLI4P10075 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GLI4P10075 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GLI4P10075 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GLI4P10075 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GLI4P10075 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GLI4P10075 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms