Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2P0DI81 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2P0DI81 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2P0DI81 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2P0DI81 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2P0DI81 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2P0DI81 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2P0DI81 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2P0DI81 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2P0DI81 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2P0DI81 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2P0DI81 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2P0DI81 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2P0DI81 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2P0DI81 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2P0DI81 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2P0DI81 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2P0DI81 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2P0DI81 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2P0DI81 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2P0DI81 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2P0DI81 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2P0DI81 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2P0DI81 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2P0DI81 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2P0DI81 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2P0DI81 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2P0DI81 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2P0DI81 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2P0DI81 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAPPC2P0DI81 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAPPC2P0DI81 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAPPC2P0DI81 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAPPC2P0DI81 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAPPC2P0DI81 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAPPC2P0DI81 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAPPC2P0DI81 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms