Protein–RNA interactions for Protein: P08962

CD63, CD63 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD63P08962 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD63P08962 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD63P08962 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD63P08962 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD63P08962 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD63P08962 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD63P08962 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD63P08962 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD63P08962 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD63P08962 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CD63P08962 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD63P08962 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD63P08962 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD63P08962 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD63P08962 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD63P08962 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD63P08962 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD63P08962 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CD63P08962 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CD63P08962 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD63P08962 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CD63P08962 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD63P08962 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD63P08962 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD63P08962 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD63P08962 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD63P08962 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD63P08962 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD63P08962 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD63P08962 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD63P08962 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CD63P08962 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD63P08962 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD63P08962 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD63P08962 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD63P08962 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD63P08962 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CD63P08962 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CD63P08962 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD63P08962 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD63P08962 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD63P08962 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CD63P08962 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CD63P08962 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD63P08962 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD63P08962 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD63P08962 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD63P08962 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD63P08962 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD63P08962 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CD63P08962 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD63P08962 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CD63P08962 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CD63P08962 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD63P08962 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD63P08962 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CD63P08962 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD63P08962 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD63P08962 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD63P08962 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD63P08962 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD63P08962 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD63P08962 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CD63P08962 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CD63P08962 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CD63P08962 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD63P08962 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CD63P08962 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD63P08962 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD63P08962 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD63P08962 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD63P08962 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD63P08962 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD63P08962 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD63P08962 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD63P08962 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD63P08962 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD63P08962 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CD63P08962 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD63P08962 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD63P08962 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CD63P08962 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD63P08962 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CD63P08962 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD63P08962 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD63P08962 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD63P08962 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD63P08962 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD63P08962 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD63P08962 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD63P08962 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD63P08962 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD63P08962 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD63P08962 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD63P08962 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD63P08962 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD63P08962 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD63P08962 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD63P08962 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD63P08962 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms