Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD3O95983 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD3O95983 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD3O95983 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD3O95983 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD3O95983 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD3O95983 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD3O95983 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD3O95983 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD3O95983 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD3O95983 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD3O95983 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD3O95983 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD3O95983 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD3O95983 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD3O95983 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD3O95983 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD3O95983 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD3O95983 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD3O95983 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD3O95983 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD3O95983 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD3O95983 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD3O95983 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD3O95983 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MBD3O95983 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MBD3O95983 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MBD3O95983 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MBD3O95983 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MBD3O95983 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MBD3O95983 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MBD3O95983 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MBD3O95983 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MBD3O95983 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MBD3O95983 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MBD3O95983 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MBD3O95983 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MBD3O95983 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MBD3O95983 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MBD3O95983 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MBD3O95983 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MBD3O95983 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MBD3O95983 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MBD3O95983 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MBD3O95983 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MBD3O95983 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MBD3O95983 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MBD3O95983 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD3O95983 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD3O95983 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD3O95983 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD3O95983 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD3O95983 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD3O95983 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD3O95983 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD3O95983 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD3O95983 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD3O95983 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD3O95983 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD3O95983 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD3O95983 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD3O95983 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD3O95983 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD3O95983 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD3O95983 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD3O95983 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD3O95983 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD3O95983 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD3O95983 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD3O95983 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD3O95983 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD3O95983 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD3O95983 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD3O95983 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD3O95983 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD3O95983 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD3O95983 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD3O95983 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD3O95983 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD3O95983 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD3O95983 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD3O95983 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD3O95983 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD3O95983 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD3O95983 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD3O95983 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD3O95983 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD3O95983 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD3O95983 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD3O95983 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD3O95983 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD3O95983 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD3O95983 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD3O95983 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD3O95983 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD3O95983 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD3O95983 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD3O95983 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD3O95983 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD3O95983 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms